据上海到承德运输专线完善水运发展规划。充分发挥长江黄金水道的水运优势，加快建设佛耳岩滚装码头二期工程，规划建设鱼洞客运码头、桃花岛游艇基地，加快建设沙湾码头，改建木洞、麻柳码头，开发连接长江并常年通航的五布河、一品河等次级河流的短程运输。结合港口交通条件、城市总体规划、产业布局、运输需求等情况，将巴南区港口规划为“2大2小”，即重点发展鱼洞中坝岛旅游码头和木洞游艇基地，同时规划鱼洞、李家沱客运码头作为小南海水电站观光旅游的停靠码头；货运码头重点发展佛耳岩码头、木洞码头、麻柳复建码头，另规划16个散货和件杂货运作业区。

     “十二五”时期，是深入贯彻落实科学发展观、构建社会主义和谐社会的重要时期，也是深入推进农村交通建设、全面提升农村路网服务水平的重要时期，根据区委、区政府的要求，结合巴南区实际，巴南区交委早安排、早部署、大手笔谋划，通过一年多的广泛调查、深入调研和分析论证，巴南区“十二五”综合交通运输发展规划正式出台。
　　一、总体目标
　　构建“系统协调、城乡一体、枢纽集成、覆盖全区”的综合交通运输网络。建立网络设施完善、枢纽功能齐全、服务高效便捷的现代化综合交通运输体系，提出了巴南区“十二五”交通发展的“1123目标”，即“1小时巴南，1小时重庆都市圈，外环以内20分钟镇到村，外环以外30分钟镇到村”，以此全面提升区域综合竞争力，支撑巴南区社会经济快速持续发展。
　　二、具体目标
　　构建“四个一”具体目标：即“一枢纽、一基地、一系统、一平台”。一枢纽：建成主城南部重要的交通枢纽，基本形成以“六横六纵十联线”为主骨架的城乡一体化公路网络，公路通车总里程达到3241公里。国省干线二级以上公路比重达到80%以上，通镇（乡）公路全部达到三级以上水平，路面铺装率达到100%，国省道路面行驶质量指数达到95以上。 一基地：基本建成西部公路物流基地，规划在巴南区南彭街道建设，属于重庆市“三基地四港区”之一。一系统：建成由铁路、公路、水运组成的综合运输系统。铁路子系统即实施铁路东南环线和轨道交通建设；内河航运子系统即实施以佛耳岩作业区、麻柳作业区为重点，以梅家梁、水子坝、沙湾、木洞等等一般作业区为补充的层次分明、布局合理、大中小结合的港口群；公路子系统即全面形成“六横六纵十联”干线公路网，覆盖巴南所有乡镇和重要经济区，主要对外干线达到二级及以上技术水平，路面全部达到水泥或沥青混凝土路面，农村公路乡镇、行政村通畅率达到100%。一平台：整合交通信息资源，以交通公众信息网和电子政务网为依托，建立既面向行业管理部门又服务社会公众的信息平台，集成公众出行信息服务系统、交通决策支持系统、交通运输市场公共信用系统等应用，逐步建成全区交通信息交换中心平台。
　　三、重点建设规划
　　（一）规划八大对外综合运输通道。利用巴南区境内现状的高速公路、河流，以及规划的铁路、公路及轨道交通，规划期内形成“一江二铁三轻四高”（“一江”是长江；“二铁”是城市铁路环线和綦江-一品-界石铁路支线；“三轻”分别是轨道交通2、3、8号线；“四高”分别是绕城高速、渝黔高速、渝湘高速和沿江高速公路）布局。努力打造8大对外综合运输通道。一是南南通道（巴南至南岸通道），以轨道（新建城市铁路东南环线、轻轨3号、8号线）、高速公路、内环快速路、渝南大道、滨江路、南泉大道（新规划）、南涪路为主要交通构成方式；二是巴九通道（巴南经大渡口至九龙坡通道），以铁路（新建城市铁路中环线、轻轨2号线）、轨道、长江大桥（李家沱、马桑溪、白居寺〈新规划〉、鱼洞长江大桥）、内环快速路为主要交通构成方式；三是南北通道（巴南经江北至渝北通道），以绕城高速公路和内环快速路、木洞长江大桥（新规划）为主要交通构成方式；四是巴津通道（巴南至江津通道），以长江航道、铁路、绕城高速公路、渝合路、国道210及渝南大道D段（规划改造建设）为主要交通构成方式；五是巴长通道（巴南至长寿通道），以长江航道、沿江高速公路、南涪路为主要交通构成方式；六是巴涪通道（巴南至涪陵通道），以长江航道、沿江高速公路、南涪路、木丰路、双羊路为主要交通构成方式；七是巴南通道（巴南至南川通道），以渝湘高速公路、渝道路、天东路为主要交通构成方式；八是巴綦通道（巴南至綦江通道），以渝黔高速公路、圣灯山路、一赵路、一陈路为主要交通构成方式。随着八大运输通道内基础设施的完善和高效的服务，将大大促进通道范围内经济社会发展，同时加强与周边区县的对接和联系，推动区域资源整合和经济发展。
　　（二）完善城乡干线公路网络规划。规划期末巴南区由高速公路、国省道和农村公路构成的三级公路网总规模达到3241公里。干线公路总里程达824.9公里（六横六纵骨架公路557.2公里，联网公路267.7公里），其中高速公路171.9 公里（已建成128.9公里，新建沿江高速巴南境内43公里）。一级公路111.7公里，二级公路229.1公里。规划期末全区公路网技术结构明显改善，国省干线二级以上公路比重达到92.8%，通镇（乡）公路全部达到三级以上水平。其中重点实施渝南大道D段（鱼胡路口至一品）、渝道路（和平桥至神童）、木隆路（接龙至黄桷段）、渝建路（茶园至惠民、瓦窑村至涪陵界段）的改造建设。
　　（三）完善农村公路网络规划。“十二五”期间将规划新建、改建农村公路1883公里。其中实施建制村通畅工程227公里，县乡道连网公路488公里，撤并乡镇通达、通畅公路24公里，自然村通达通畅公路1043公里，农场、林场农村公路21公里，旅游景点、园区、农业产业区公路80公里。计划共需改建农村公路1545公里，新建农村公路338公里。其中重点实施鸡天路（鸡公台至樵坪米业）、广木路（广阳经木洞至丰盛）、光南路（光国经界石至一品）、和东路（和平桥至雾露洞）、惠南路（惠民至南彭）的改造建设。经初步测算，要完成以上农村公路建设目标，共需建设资金约30亿元。同时针对实施通畅工程后的农村公路里程的不断增加，养护技术、标准的越来越高，未来五年内全区预计需养护资金约2.5亿元。通过大力加快农村公路建设，强化农村公路管护，进一步完善我区农村公路路网结构，提升农村公路技术等级，改善农村地区的通行条件。
　　（四）完善运输服务体系规划。一是农村客运线路。全区规划开行农村客运线路46条，新增运力188台，分布在境内的丰盛镇、双河口镇、界石镇、东温泉镇、鱼洞街道等18个镇街，总运营里程达到371.48公里。二是公共交通规划。拟新增公交客运线路5条，分别是鱼洞至龙头寺火车北站、鱼洞至红旗河沟、鱼洞至大学城、鱼洞至北碚和鱼洞至花溪工业园区，另外，拟延伸公交客运线路1条， 238路石桥铺至鱼洞延伸至香林华府。三是城乡物流规划。以发展区域物流为主体，兼顾全国物流，完善本地物流，将物流产业作为巴南未来十年首要发展的产业，发挥其发展物流的带头作用，向周边地区辐射，从而构筑成布局合理、功能完善、网络化和标准化的物流体系。规划建设1个物流基地（南彭公路物流基地）和3个物流中心（鱼洞、界石、一品配送中心）。四是枢纽及站场建设规划。规划建设1个换乘主枢纽（鱼洞交通换乘主枢纽）、4个区级客运站（一品、鹿角、南彭、木洞客运站），23个乡镇客运站，77个村级招呼站。